室间隔缺损目前主要有介入封堵术和外科手术直接修补两种手术办法。产生的后遗症跟室间隔缺损的基础病变有一定关系，手术时机不对也会导致一系列的后遗症，比如已经有肺动脉高压，那无论是介入和开放手术，肺动脉高压可能还会继续进展。
介入顾名思义就是要通过血管腔隙，将封堵器直接输送到室间隔缺损的部位，血管的损伤，包括封堵器产生的残余瘘，残余瘘之后产生脓血，包括Ⅲ度传导阻滞，这都是后遗症。如果产生这些严重的后遗症，有时还要进一步转化为开胸手术解决。
开胸手术通常也会产生一系列的后遗症，如Ⅲ度传导阻滞、残余瘘，如果损伤到一些重要结构，都会遗留一些并发症、后遗症。但是绝大多数情况下，室间隔缺损的各种治疗办法还是相对比较安全，所以一定不要由于顾忌后遗症，而不去进行积极干预。
