多数情况下吃避孕药不会导致停经，如短效避孕药是在月经第5天开始服用，有人月经3天干净，就是在月经已经干净的情况下服用，连续服用21天再停药。停药后子宫内膜失去避孕药的雌激素和孕激素的支撑，会出现子宫内膜脱落出血，即临床来月经，因此不会出现停经。如果出现停经，可能是口服避孕药怀孕，才会导致停经。
短效避孕药避孕效果较好，可以抑制排卵，使子宫内膜变薄，阻止受精卵着床，以此达到避孕目的。如果在吃避孕药时没有抑制排卵，就有可能怀孕。此外，子宫内膜变薄并没有达到阻碍受精卵着床的程度，也可能怀孕，因此要做早早孕检测，排除怀孕的可能性。
如果来月经之后吃避孕药，没有按照规定服用，连续服用天数不只是21天，而是1个月或者更长时间，也会导致停经，因此要按说明应用。
