射精以后尿道不舒服，最常见的原因就是后尿道的局部炎症刺激。临床上常见的原因，就是前列腺炎、精囊炎，引起的射精以后尿道不舒服。
因为这些炎症因子，包括一些精液里的微生物，刺激后尿道、刺激整个精阜部位，引起局部的黏膜水肿、充血，造成了神经的敏感。在射精以后，该部位尿道痉挛、收缩，帮助排精，造成了后尿道的一些疼痛、不适这些症状。
所以出现尿道不舒服症状，要先进行抗炎治疗，服用一些有效的抗生素。同时要提肛锻炼、热水坐浴，促进肛门周围的血液循环，提高肛门周围肌肉收缩，加快炎症消退、血液循环，促进炎症改善。
