急性肠胃炎患者住院的时间，取决于感染的微生物类型。若为常见的大肠埃希菌、金黄色葡萄球菌等引起的急性胃肠炎，虽然发病率高，但病程较短，经过有效治疗后可以迅速缓解症状，通常1-3天即可出院。而沙门氏菌引起的食物中毒，其中毒症状较重，会出现腹痛、腹泻、恶心、呕吐 、高热甚至脓毒血症表现，有时住院时间高达7-14天。所以根据不同类型的微生物引起的急性胃肠炎，住院时间和治疗周期也不同。
急性胃肠炎的治疗，先要嘱咐患者改变进食方式，给予流质饮食或半流质饮食，再逐渐转为清淡饮食。呕吐为急性胃肠炎常见症状之一，要给予患者有效的止吐治疗，临床上可以使用甲氧氯普胺、中枢性止吐剂或B族维生素进行止吐治疗。若患者出现明显腹痛，可考虑给予解痉药物进行止痛治疗，临床常用的如山莨菪碱等。根据引起急性胃肠炎的病原微生物种类，会给予相应的抗感染治疗，通常选用喹诺酮类和氨基糖苷类药物进行治疗。
