肩关节积液且疼痛最佳的治疗方法，是在准确诊断的基础上进行对症治疗，包括保守治疗和手术治疗。引起肩膀疼痛的原因比较多，包括肩关节的退变、炎症反应，炎症引起的滑膜增生会导致关节积液。
一般应该常规拍摄肩关节的X线片和核磁共振进行检查，引起积液和疼痛的疾病，比如肩峰撞击综合征、钙化性肌腱炎、肩袖肌腱病、冻结肩等。对于炎症为主的疾病，可以进行肩关节的休息，减少关节活动量，不要做刺激关节疼痛的动作。
另外可以口服抗炎镇痛药物，比如扶他林(双氯芬酸钠)、西乐葆(塞来昔布胶囊)，如果症状比较明显，也可以在关节腔和肩峰下的间隙注射复方倍他米松，进行关节内强效的抗炎治疗，缓解疼痛。如果疼痛已经缓解，再进行肩关节的功能锻炼，功能可以逐渐恢复。
通过检查发现肩袖肌腱撕裂或者关节不稳、盂唇韧带损伤引起的关节积液和疼痛，往往需要手术，进行结构的修复，结构愈合之后再进行康复锻炼，能够恢复正常功能，积液和疼痛都会消失。
