进行胚胎移植后3-4天，在刚刚胚胎进行定位和着床时，大部分女性没有特殊临床症状。因为胚胎的体积较小，而子宫腔又相对较大，所以其在子宫腔内的活动不至于造成子宫有感觉，也不至于造成女性身体有特殊感觉。所以胚胎着床的早期，大部分女性没有感觉，但少数女性较敏感，可能会觉得小肚子有疼痛、坠胀感，但上述症状不是胚胎着床的特异性症状。
如果胚胎着床的时间较长，到快月经来潮时，即胚胎移植后2周，部分女性因为胚胎活性较好，释放的人绒毛膜促性腺激素较多。如果这部分患者较敏感，可能会感觉乏力、早晨恶心或头晕等类似早孕的症状，但是半数以上的女性此时没有上述早孕症状。
