毛发移植对于头皮有伤害，因为其为有创操作，在头皮上进行提取毛囊和植入毛囊都有创，会留下相应的瘢痕。此类瘢痕在术后有头发遮盖看不到，但是留光头或者很短的头发，此类瘢痕，尤其是后枕部提取过的地方，瘢痕还能看到。所以做完毛发移植术后，不建议再留光头，适当长度的头发能够得到更好的效果。
但对于上述危害而言，术后得到的效果是更大的安慰，得到一些植发效果后会非常高兴，而忽略掉手术的危害。除了瘢痕和创伤以外，植发对于部分特殊疾病，如不适合做毛发移植的疾病，如斑秃或者其他类型的暂时性脱发等都有危害。所以在选择植发的适应证上，也要注意，对于不能植发的地方，如果做了毛囊植发手术，则绝对有害。
在术前要经过周密的勘察，才能最终给患者确定手术方案，才能让患者受到一点小伤害，但是能够得到良好的植发效果。对于适合毛囊植发的患者而言，毛囊植发是一个特别好的治疗方法。但是对于不适合做毛囊植发的疾病，一定要排除掉，用其他方法进行治疗。
