四价疫苗指的是HPV疫苗，是针对4个HPV病毒的亚型，而九价疫苗针对9种亚型，其主要针对高危型，以及2个低危型。2个低危型即HPV6型和11型，此2型主要引起外阴的尖锐湿疣，是一种性病，其他的都是高危型。
四价的疫苗针对6型、11型、16型和18型。HPV16型和18型是非常高危的2种类型，尤其16型占到一半的宫颈癌，16和18型宫颈癌两者加起来占到将近70％多的宫颈癌。
其他的高危型，其中九价疫苗还针对另5种高危型HPV病毒，包括31型、33型、45型、52型和58型，是临床感染比较常见的高危HPV病毒。所以四价和九价的疫苗，只是针对病毒的种类有区别。
