目前在市面上已经可以开始使用的HPV疫苗有二价、四价以及九价，二价疫苗主要是含有HPV16型和HPV18型两种病毒的疫苗，二价疫苗主要是针对于宫颈癌有预防作用，因为HPV16型和HPV18型都是导致女性发生宫颈癌最为常见，也是最高风险的病毒类型。HPV16型可能会与女性的宫颈鳞状上皮癌有密切的关系，HPV18型则与女性腺上皮癌的关系非常密切，所以二价疫苗的注射可以起到预防女性发生宫颈癌的作用。
四价疫苗在HPV16型和HPV18型的基础上增加了两种低危型的HPV病毒，也就是HPV6型和HPV11型，这两型病毒主要是导致女性生殖道的尖锐湿疣，所以四价疫苗在预防宫颈癌的同时，还可以起到预防性传播疾病的作用。九价疫苗是在四价疫苗的基础上又增加了对几种HPV病毒的预防作用，所以目前市面上只有二价、四价和九价的HPV疫苗。
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