填充脂肪有后遗症，较严重的后遗症是脂肪栓塞。目前社会上关于脂肪栓塞的报道较多，严重时可以引起失明、皮肤坏死以及引起肺栓塞和颅内血管的栓塞。肺栓塞和颅内血管的栓塞可以引起呼吸困难、偏瘫、失语、意识障碍，严重时可以危及生命。如果发展到皮肤，皮肤形成的创面将来会有瘢痕，甚至是面部大面积瘢痕，较难修复。

脂肪填充需要抽取自体脂肪，抽脂的部位可能会出现出血、血肿、凹凸不平、粘连。如果每个脂肪填充的部位填充过多，则会出现结节、包囊，即形成囊肿或有钙化，还可出现不对称。因为面部、乳房的脂肪填充都是双侧，不注意则会引起不对称。此外，还可以出现凹凸不平，有些地方填充得过多或过少，或者和想要的不一致，都会引起凹凸不平。如果填充过剩，可能会到肌肉里形成血肿，将来还可以形成粘连。在笑的时候或有表情时，可以出现表情不自然、不对称。

所以脂肪填充需要掌握好方法，注意好层次，每一点不能填充过多，一般讲究多点、多层次、少量注射。如果脂肪存活不好，则会形成钙化结节、包囊。而填充的层次不对会损伤底下的肌肉，引起出血、表情异常或容易感染。