CT有辐射，磁共振没有辐射。头颅CT的辐射量为2mSv，胸部CT的辐射量是8mSv。尽管CT有一定辐射，但检查过程中会采取防护：
1、在敏感部位和器官上用铅皮遮盖，最大程度的减少辐射损伤；
2、目前CT机比较智能化，即配有自动毫安的装置，在CT的检查过程中，会根据扫描部位不同而自动进行扫描参数的调整，自动的降低毫安，可最大程度的减少辐射剂量。
磁共振没有辐射，是非常安全的检查方法，但磁共振有一定的检查适应症：
1、有金属植入物和安装了心脏起搏器的患者不宜做磁共振的检查；
2、因为磁共振检查时间较长，所以有幽闭恐惧症及外伤后烦躁不安的病人也不适宜做磁共振检查；
3、磁共振是一个磁场，所以医务人员、患者和家属进入磁共振检查内时要去除所带铁磁性物质，如手机、硬币和发夹等，如果不去除，可能会影响图像质量，甚至造成人身的损伤。
