如果患者在移植后12-14天明确妊娠，但合并少量阴道分泌物，主要包括以下几种情况：

1、胚胎着床：实质上大部分属于正常情况，可能为胚胎着床过程中的侵袭性过程。在胚胎着床过程中，触碰到某根毛细血管，使毛血管破裂，出现少量出血。如果患者出现少量褐色分泌物，且出血量不会增多。此时需要卧床休息，同时加强保胎治疗，无需进行特殊处理；

2、宫外孕：如果确定胚胎移植成功且HCG呈阳性时，还可能出现宫外孕，主要因种植在输卵管上，可能出现子宫内膜蜕膜样改变，出现出血，患者会出现少量咖色分泌物。通常患者发生宫外孕，与正常宫内孕的HCG检查，其血HCG值相对偏低。在动态观察血HCG变化时，升高情况不佳。

因此患者妊娠12-14天时HCG值偏低且伴褐色分泌物时，建议定期检测HCG数值的翻倍情况。如果数值增长不佳，需要警惕宫外孕情况。

但宫外孕仅依据血HCG值翻倍情况难判断，此时需要在移植21天左右时进行阴式B超，以检查胚胎在宫内或宫外。如果胚胎种植在宫内，移植后21天可以观察到。如果在21天时没有在宫内观察到孕囊，需要引起警惕，并随机准备进行B超检查。

如果患者出现腹痛、阴道出血增多症状时，需要随时到医院就诊。同时家中需要有人陪伴，因宫外孕可能引起输卵管破裂、出现失血性休克，甚至危及生命。