通常情况下甲状腺基因检测有用，甲状腺基因检测，可以对明确诊断的甲状腺癌患者进行标本检测，也可以对甲状腺患者进行血液样本筛查，检查患者是否存在患有恶性甲状腺疾病。现在临床上用的主要是标本检测，通过对组织标本分析、基因分析，检查哪些基因突变与甲状腺恶性疾病有关。

临床上对于怀疑的甲状腺结节以及淋巴结，进行术前分析，尤其是要做BRAF分析。较多甲状腺结节或者可疑淋巴结转移患者，做细胞穿刺无法明确，如果做基因分析，尤其BRAF分析，发现是阳性，大概可以明确患者是甲状腺癌，可以让临床做下一步治疗，尤其是手术治疗。除做细针穿刺组织切片基因分析外，还要做手术标本的基因分析，例如手术切下来的肿瘤标本，进行甲状腺相关基因或者甲状腺基因检测，包括BRAF、KRAS以及EGFR等。通过上述检测方法，检查甲状腺癌的严重程度、类别或者特殊类型，然后选择下一步治疗计划，评估患者的危险度，以及预期疗效。

对于甲状腺基因检测，目前临床上也在做进一步研究，对于已经做过治疗、疗效不好，尤其碘-131治疗效果不好的患者，存在远处转移，处于中晚期癌症的患者，也可以通过新增穿刺或转移标本进一步分析。