胚胎停育大多数是发生在妊娠12周以内，尤其是以妊娠8-9周比较常见。通常在女性月经周期正常的情况下，在月经过期1周，即可通过尿妊娠试纸，检测出怀孕，可以通过超声看到宫腔内的妊娠囊。再过1-2周，即怀孕8-9周时，可以通过超声看到胎心搏动以及胎芽存在，从而可以证明目前胚胎发育水平良好，没有发生胚胎停育。如果在怀孕8-9周，超声检查未看到胎芽和胎心，或者只是空囊存在，则可能是发生胚胎停育。

不排除部分女性的月经周期较长，可能40-50天，甚至2个月才来一次月经。这种情况即使在怀孕8周时没有看到胎芽、胎心，仍不能确定是胚胎停育，建议1-2周后再做一次超声检查，进行确认。如果仍没有胎芽和胎心活动，或者胚胎根本没有发育，则诊断为胚胎停育。绝大多数胚胎停育是发生在怀孕12周以内，但目前发现也有在怀孕16周左右出现胚胎停育，这种情况通常与自身免疫性疾病等异常情况有关，需要进行进一步检查。