督脉灸的作用与功效主要是补阳气。督脉是人体一身阳脉之海，所以督脉灸能够补五脏六腑的阳气，也可以补十二条正经的经络阳气，督脉灸作用于督脉上，对补充阳气的作用会更加明显。
督脉灸是从大椎开始，一直会灸到长强，灸的时间有的可能会半个小时，有的甚至1-2个小时都有。灸法主要是要将其灸通透，可以起到助阳散寒、温经通络、消炎止痛的作用。
主要用于治疗颈肩腰腿痛，脊柱的相关疾病比如强直性脊柱炎、腰背肌筋膜炎、腰椎间盘突出、胸椎小关节紊乱，还有和小关节紊乱相关的比如肠易激综合征、心脏神经官能症、老慢支、肺气肿，这些都可以通过督脉灸得到改善，还有妇女的宫寒，即妇女的月经不调、痛经。
