怀孕有可能引起卵巢囊肿，因为在怀孕早期，体内分泌大量孕激素、雌激素等。激素会作用于卵巢组织，而导致黄素化囊肿，即卵巢有囊肿生长。黄素化囊肿通常属于生理性，在怀孕3个月以后体内激素趋于平稳，囊肿会自行消退。极少数卵巢囊肿，称为黄体化囊肿或黄素化囊肿，有可能过于增大以后发生扭转等，可能需要手术，通常无需进行任何干预。
有些特殊病人进行试管婴儿或辅助生殖技术，使用大量激素以后，使卵巢过度增大，而导致卵巢过激的情况，卵巢类似于囊肿，但是对于怀孕没有影响。因此在怀孕期间，卵巢变化属于囊性，在早孕期发生，在怀孕中期会消失，没有影响。如果是实质性囊肿，则需要排除有无卵巢癌的风险。
