干细胞填充具有一定危害性，可能会发生并发症。干细胞的填充治疗目前仍处于临床试验阶段，并未在临床大范围推广，也未经过国家药监局正式的批准。干细胞注射填充的效果、并发症或危害并无系统的试验数据，但从常规治疗而言，任何治疗均存在并发症或危害。
干细胞填充可能会在注射填充过程中出现出血、感染、血肿形成等，甚至可能损伤重要的血管和神经。干细胞填充的应用范围比较广，包括关节内注射等，而是否会引起关节感染或者其他功能障碍，目前仍停留在临床试验的阶段。因此，建议患者进行干细胞填充时需保持谨慎的态度，根据自身实际情况，到正规的医疗机构咨询，相对更为安全。
