小鸡疼一般指阴茎疼，如果6岁的男孩阴茎疼，首先可以自查，明确男孩阴茎的外观，如阴茎头，包括整个阴茎体、包皮有没有红肿，可能是以下原因引起：

1、包皮龟头炎：如果仅是阴茎疼，没有其他症状，可以观察到包皮口红、包皮肿，可能存在包皮龟头炎。此种情况下应该让男孩多喝水、多排尿，同时可以用红霉素眼膏外用，基本上就达到治愈的作用；

2、尿路感染：但是如果男孩除阴茎疼外，还可能有其他问题，如尿急，男孩迫不及待地需要上卫生间；尿痛，男孩在排尿过程中会表示尿道感觉有针扎样感觉，或者火烧样感觉；还有尿频，即刚上过卫生间，可能1-3分钟又需要上卫生间，但每次尿量很少，此时可能就是尿路感染的情况。通过查尿常规，会发现白细胞较多，同时细菌计数也增加，对于尿路感染，除多喝水外，若症状重可能还需要口服抗生素，可以口服头孢类的抗生素；

3、其他疾病：如果男孩除阴茎疼、尿路感染外，还合并发热、寒战、高热的情况，可以进一步检查B超、彩超，明确男孩有无整个膀胱炎或者整个尿路，如急性肾盂肾炎此种少见的情况。

因此一个6岁的男孩阴茎疼，要明确局部情况，同时要照顾全身，如果仅为局部情况，局部处理就可以。若是全身的情况，还要根据其他问题对症处理。