肥儿丸的主要成分是神曲、黄连、使君子、炒麦芽、肉豆蔻、槟榔、木香等，主要作用是清热杀虫、消食化积、温脾止泻，临床主要用来治疗由于肠道寄生虫引起的疳症，临床可以表现为面黄肌瘦、腹胀、便溏、发热、口臭。
小儿疳积主要是由于脾气虚弱、脾失健运出现消化不良引起发热，寄生虫在肠道日久容易形成疳症。如果出现这种情况，治疗时主要是以杀虫、消食为主要的治疗方法。
肥儿丸方里有使君子，使君子主要有杀虫的作用，同时槟榔、神曲、麦芽可以消积、化食，木香、肉豆蔻可以温脾止泻。另外还加黄连，黄连和使君子配伍可以清热、去虫，所以肥儿丸主要适合杀虫，即肠道寄生虫引起的疳症。
虽然叫做肥儿丸，但是从肥儿丸的成分来看，主要是消食化积、清热杀虫，不属于补益药，所以肥儿丸不能长期服用。
