通输卵管时会存在轻微疼痛，疼痛强度依赖个体感觉差异、输卵管黏连及堵塞程度、手术操作等。通常进行输卵管通液或通输卵管检查及治疗时，主要针对于不孕检查。一部分人会感到疼痛，甚至疼痛难忍，而一部分人无任何不适感。如果输卵管通畅，则疼痛感较小或无不适感，如果输卵管堵塞，则疼痛较强烈、明显。
另外即便输卵管通畅，由于通液温度刺激，如通液过快或过凉，可以导致输卵管痉挛，而出现疼痛。现代医学发展，可选择无痛的输卵管通液或输卵管造影检查，即在静脉麻醉下，选择输卵管造影、输卵管通液。输卵管通液对于轻度黏连，由于压力作用使黏连松解，从而达到通畅目的，并且可以通过检查判断输卵管解剖形态及生理功能。
