出现乳腺、胰腺、肝脏、妇科等疾病时，会出现糖类抗原125升高。糖类抗原125是常见的肿瘤标志物，主要是用来筛查妇科肿瘤，比如卵巢、卵巢癌、子宫肌瘤等。乳腺方面主要是筛查乳腺囊肿、乳腺癌，胰腺方面主要是胰腺癌。但并不是所有的肿瘤标志物升高，都提示着一定是妇科、乳腺、胰腺等疾病，还要根据升高的程度，以及持续时间。
另外其它伴随的疾病，对糖类抗原125也有一定影响，比如肝硬化时，也容易引起糖类抗原125升高。所以平常糖类抗原125检测，主要是针对有乳腺、胰腺，以及妇科等相关肿瘤时，进行了一项肿瘤标志物的筛查。当它出现升高时，需要进一步去筛查是否有肿瘤存在。必要时，可能需要进行活检，甚至手术来进一步明确肿瘤的病因，以及肿瘤的性质。
