在临床应用过程中，镇静药有一定的副作用或危害，如果不恰当地应用，长期地应用、滥用等，会造成严重的呼吸抑制、呼吸暂停、心血管不平稳、循环抑制，甚至心跳停止等严重情况。
在应用过程中，镇静药的副作用主要与应用的剂量、浓度、持续时间相关。如果大量滥用，会造成中枢大脑严重抑制，从而抑制患者的呼吸、循环，造成血流动力学不平稳。
所以在应用镇静药的过程中，尤其是在围术期或手术过程中，要严密地监测患者的呼吸、循环、血压、脉搏、心率、氧合、呼气末二氧化碳、肌肉松弛等情况，保证病人在应用过程中的安全平稳。
如果出现危象或出现呼吸抑制，在复苏期需应用拮抗药，如洛贝林、尼可刹米、氟马西尼等呼吸系统兴奋剂，对抗在镇静药过程中的超量或者蓄积，保证患者能快速地苏醒。
