圆锥角膜目前比较公认的治疗方法是进行角膜交联治疗。角膜交联治疗实际上是鉴于对圆锥角膜的发病的机理的研究。研究发现角膜是很多层的纤维板材，原来板材和板材之间都是很紧密的连接，但是圆锥角膜的病人这些板材之间开始滑脱，就推断是因为板材和板材之间的连接变得不紧密。交联治疗就是增加角膜胶原层、纤维层之间的层间连接，导致角膜的胶原纤维变得更紧密。

如果已经发生圆锥角膜的患者，进行角膜交联治疗了以后，不仅是可以增加的强度，制止病情的进展，还有极个别人甚至会改善屈光状态。还有一种治疗方法就是RGP，是一种硬性的角膜接触镜。有很多医生认为RGP是可以改善圆锥角膜，特别是早期圆锥角膜的角膜前突。但是也有一些医生会认为，圆锥角膜即使在早期也会向前突了，硬性的角膜接触镜会对已经突起的角膜造成一定的磨损。

国际上还有一种方法，目前在国内没有准入，叫做角膜基质环的植入。是在角膜的中周基质层内植入环形的结构，这个结构进行长期的观察以后，发现和周围的角膜组织会产生混浊、粘连等反应。目前国内也没有准入，这种方法还有待进一步推敲和进一步考证。