宫颈癌疫苗可以防治的疾病包括宫颈癌，还有宫颈相关部位，如阴道癌、外阴癌、肛周癌。而且除宫颈癌以外，还可以预防再次感染外阴尖锐湿疣。因为宫颈癌疫苗是用以预防感染与宫颈癌有关的HPV病毒，HPV病毒目前已有大约200种亚型，其中与宫颈癌关系最密切的为16型和18型，以及高危HPV病毒，所以宫颈癌疫苗也就是预防感染跟宫颈癌有关的HPV病毒的高危亚型。
除高危亚型以外，还覆盖了与外阴尖锐湿疣有关的HPV6型和11型，这两种低危的HPV亚型。所以接种宫颈癌疫苗后，可以有效防止感染HPV高危亚型，以及与尖锐湿疣有关低危HPV亚型。不同价位的宫颈癌疫苗，覆盖HPV的亚型有所不同。二价预防两种，四价预防四种，而九价宫颈癌疫苗，可以预防九种HPV亚型。
