艾灸合谷穴的时间通常不会过长，因为合谷属于大肠经穴位，若较长时间灸大肠经穴位，可能会导致大肠蕴热，出现便秘现象。甚至还可能出现牙痛、头痛、眼睛发涩，以及目赤、颈痛、咽干、口干、喉干等现象。因此灸合谷适合于慢性腹泻、寒湿患者，如局部头面部寒湿等，但通常不会灸较长时间。

由于穴位有穴性，合谷穴可以补虚也可以泄实，但主要用来泄实，即用于治疗实证，若长期使用艾灸进行补充能量治疗，可能会出现上火现象。而足三里、三阴交、太溪等穴位，主要用来治疗虚证。