革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌是根据革兰染色法对细菌进行分类，二者常见的区别如下：

1、染色差异：细菌先通过碱性染料结晶染色，而经碘液媒染后，使用酒精脱色。在一定的条件下，部分细菌不脱色，部分可以被脱去颜色。因此可以将细菌分为两大类，不脱色类称为革兰氏阳性菌，脱色类称为革兰氏阴性菌。为了方便检查，脱色后再用一种红色的染料，比如碱性番红液进行复染，阳性菌仍然呈紫色，而阴性菌则被染上红色；

2、结构差异：革兰氏阳性菌细胞壁的肽聚糖较厚，有磷壁酸，但是缺乏外膜。而革兰氏阴性菌细胞壁的肽聚糖较薄，没有磷壁酸，但是存在外膜；

3、治疗差异：革兰氏阳性菌对青霉素类抗生素敏感，而革兰氏阴性菌对青霉素类不敏感，通常对四环素类抗生素、碳青霉烯类等抗生素敏感。常见的革兰氏阴性菌，包括葡萄球菌、链球菌、肺炎双球菌等。常见的革兰氏阴性菌，包括痢疾杆菌、伤寒杆菌、大肠杆菌、变形杆菌、铜绿假单胞菌等。因此区分病原菌是革兰氏阳性菌，还是革兰氏阴性菌，对选择抗生素方面，具有很重要的指导意义。