针对巴氏腺囊肿长到多大需要开刀手术因人而异，最主要的临床指征取决于病人自己的感受。如果巴氏腺囊肿发生继发性感染导致巴氏腺脓肿，感染会导致病人出现非常严重的红、肿、热、痛等炎症典型表现。局部皮肤由于充血变红，局部肿胀让病人感受到膨胀的压力疼痛，严重影响生活工作。因此巴氏腺脓肿适当时必须予以切开引流，否则给病人带来痛苦极大。

1、不能耐受：巴氏腺囊肿能够达到2-3公分时，病人自己无论是骑车，采取坐位或者直立行走时都能够感受到躯体上的不适，甚至有可能会严重的影响自己的日常生活，这样的巴氏腺囊肿就应当给予切开引流处理；

2、能够耐受：如果是对于特殊位置，巴氏腺囊肿尽管长得很大能够达到3公分甚至4-5公分，可是病人自己可以耐受，没有任何生活上的不便。这种囊肿还可以再继续观察，等待有可能会有自然吸收的时候。

对于巴氏腺囊肿多大需要进行开刀的手术，需要进行巴氏腺囊肿的切开、造口、引流，则最主要还是取决于病人自身。如果很小的囊肿让病人也感受到了不适，随时可以进行手术。如果很大的囊肿但是病人自身不愿意手术，也是可以继续观察的。