盐酸小檗碱片属于非甾体类抗炎药，对细菌只有微弱的抑菌作用，但是对痢疾杆菌、大肠杆菌引起的肠道感染有效，适用于肠道感染，如胃肠炎。盐酸小檗碱口服的不良反应较少，主要是胃肠道反应，如恶心、呕吐，还可见皮疹和药热等过敏反应，用药后通常会消失。
本品禁用于溶血性贫血患者，以及葡萄糖-6-磷酸脱氢酶缺乏的患者，女性妊娠期前3个月时应慎用本品，如果服用过量或出现严重不良反应，建议立即就医。本品和其他药物可能会发生相互作用，所以如果正在服用其他药品，在使用盐酸小檗碱前建议咨询医师或药师。避免和含有鞣质的中药合用，因为鞣质是生物碱沉淀剂，二者可能会发生结合反应，生成难溶性的鞣酸盐沉淀，从而影响药效，因此用药时要引起注意。
