对于扁桃体肥大，它的特效药主要是对于革兰氏阳性细菌感染比较有效，如头孢类的抗生素、阿莫西林、青霉素类的药物，这类药物主要针对革兰氏阳性疾病感染比较敏感。
扁桃体发炎主要是由于身体抵抗力下降，细菌病毒侵犯到上呼吸道出现的以革兰氏阳性细菌感染为主的扁桃体炎症，所以头孢类的抗生素，或者是阿莫西林、青霉素类的抗生素等都非常好，治疗扁桃体肥大或者扁桃体发炎的抗生素。
对于扁桃体发炎，如果伴有发烧或者急性感染，建议在急性的感染期还是需要全身输水，这样可以控制急性炎症。当急性炎症控制好以后，可以后续口服抗生素来巩固疗效。
