糖链抗原包括多种抗原，不同的抗原升高所代表的意思不同。其中糖链抗原125出现升高，提示可能患有卵巢癌、乳腺癌等疾病，糖链抗原153升高提示可能患有乳腺癌等疾病，糖链抗原724指标升高提示可能患有胃癌、肠癌、前列腺癌等疾病。
除上述癌症疾病可以引起糖链抗原升高外，还有部分炎性病变可能导致这项指标升高，或是组织脏器发生的良性肿瘤也可能会导致糖链抗原升高。因此临床上出现糖链抗原升高，应该完善相关的影像学检查以及必要的病理学、内窥镜等检查来明确原因。
不同原因导致的糖链蛋白升高，其代表的意义不同。良性病变经过有效的抗炎治疗后或手术切除良性肿瘤，指标多数会恢复正常，而癌症病变导致的指标升高，需要根据癌症的不同分期，积极采取治疗措施，才能使指标恢复正常。
