如果出现突发的肚子痛，拉肚子次数较少时，可以服用黄连素、整肠生，同时在治疗过程中，尽量不喝酒、吃辣椒、吃冷冻食物，多数病人可缓解。若肚子痛、拉肚子程度较重、次数较多，如1天拉5-8次水泄便，此时尽量不要自行干预，应去医院查血常规。检测急性胃肠炎的腹泻、肚子疼是否由细菌感染引起，如果血常规发现白细胞较高，需要口服抗生素。如果不口服抗生素，腹泻时间就会较长，迁延不愈。部分患者可能会持续腹泻1个多星期，可能出现水、电解质紊乱。
腹泻、肚子疼时，通常会选用喹诺酮类抗生素，如临床上使用较多的左氧氟沙星，对这类药物过敏的患者，还可选用头孢地尼类药物。这类药物能够效对抗肠道细菌感染，如果水泄症状较重，还可使用蒙脱石散、肠道益生菌协同治疗腹泻。
