手掌腱鞘囊肿可以选择保守治疗或者手术治疗，对于手掌腱鞘囊肿，可以采用休息、理疗、外用药膏、口服非甾体消炎药等措施治疗，经过这样的治疗以后，囊肿会慢慢变小甚至消失。如果囊肿一直不消失，而且囊肿较大，又不想做手术，可以采取穿刺治疗。通过穿刺把囊肿壁里的胶冻样囊液挤出来，同时可以在囊腔里注射激素，使囊壁进行粘连，避免再复发，这是相对微创的方法。
想彻底去除囊肿，应该做手术把囊肿的囊壁整个切掉，连着内容物整个切掉就不容易复发，可以治愈疾病。一般手掌腱鞘囊肿都是因为用手太多，肌腱过度疲劳，导致腱鞘发炎，发炎以后腱鞘会渗出，胶冻样液体形成囊肿，所以要注意休息，避免过度劳累。
