做试管婴儿时，通常男方取精安排在取卵日当日上午。因为一个生殖中心可能一天有多个取卵的患者，男方的取卵顺序，通常会按照女方取卵的顺序安排。男方到专用的取精室，取出精液，然后交给实验室。
如果是由于梗阻性的无精导致需要做试管婴儿，这种需要男方的男科医师进行附睾的抽吸或睾丸的穿刺术，也是安排取卵日当天进行男方的手术。然后把手术取出的附睾抽吸液体，或者是睾丸穿刺组织，交给试管婴儿的实验室人员，完成组织里精子的处理和优化。
对于取精困难的男性，考虑到取卵当天，如果不能够成功地取出精液，也可以在取卵日之前的某个时间冷冻精液，然后在取卵当天，把冷冻的精液解冻之后使用。还有部分男方精子质量差，上午留了到下午使用时，已经明显不好，可能下午需要第二次留取精液。
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