有卵巢囊肿可能会影响怀孕，也可能不会，需要具体情况具体分析，如下：

1、会影响怀孕：部分卵巢囊肿会影响怀孕，比如巧克力囊肿通常在临床上会表现为不孕，还会导致进行性加重的痛经。此外，随着卵巢浆液性囊肿、黏液性囊肿增大，可能会导致内分泌受到影响，从而引起月经紊乱，此时可能会影响怀孕；

2、不会影响怀孕：部分囊肿对怀孕不会造成影响，比如生理性的卵巢囊肿，如黄体囊肿，黄体囊肿通常在来月经后会缩小或消失，并不会引起任何临床症状，所以对怀孕不会造成影响。此外，还有卵巢浆液性囊肿、黏液性囊肿等囊肿较小的情况下，对怀孕不会造成影响。

因此，若卵巢局部囊肿是生理性囊肿，不用给予任何处理。若是卵巢巧克力囊肿且直径＞5公分，此时可以考虑手术治疗，而且在手术后尽快准备怀孕。若是其他的病理性囊肿且直径＞5公分，也可做囊肿的剔除手术治疗，手术后对怀孕也不会造成影响。

此外，也建议女性要定期做妇科检查，通过妇科检查了解盆腔是否有肿瘤。