碳14尿素呼气试验的正常值为＜100dpm，此时提示体内并不存在幽门螺杆菌，如果＞100dpm，数值越高，显示体内可能存在幽门螺杆菌的可能性越大。但碳14尿素呼气试验的数值可能会受到药物、饮食以及一些疾病状态的影响。如果近期服用过抗生素，随后进行呼气试验，可能会出现假阴性。因为抗生素可以抑制幽门螺杆菌活性，从而导致检测不出幽门螺杆菌，但其实受检者体内有细菌存在。

同理，如质子泵抑制剂，包括奥美拉唑、艾司奥美拉唑、雷贝拉唑、泮托拉唑等，以及铋剂，包括胶体果胶铋等，这些药物同样也会抑制幽门螺杆菌活性，使检查结果出现假阴性。因此，当进行碳14尿素呼气试验之前，至少停用抗生素4周以上，停用胃药2周以上。如果存在较为严重的疾病时，如发现上消化道出血，考虑存在消化性溃疡，在急性期时做呼气试验也可能会出现假阴性，所以通常需在出血停止1个月后再进行复查，结果会更为准确。