肝胰壶腹的准确位置是在十二指肠乳头的开口和胆管的下段以及胰管的末段，是一个比较重要的解剖位置。十二指肠呈C字形包裹住胰头，旁边就是胆管，胆管的作用是收集肝脏分泌的胆汁，收集后运输到十二指肠。胰腺有主胰管，主胰管负责收集胰腺分泌的胰液，在胰管末端和胆管末端会合，会合后会有局限性的膨大称为肝胰壶腹。

肝胰壶腹周围有括约肌包绕，有利于机体控制消化液的排空，肝胰壶腹开口于十二指肠的乳头，将消化液通过十二指肠的乳头排泄到十二指肠腔，参与到机体食物的消化。