手少阳三焦经与其他经脉一样，所有经络都内连脏腑，外络肢节，它既能够反映病情，又能够运行气血，还能够治疗疾病，这是所有经脉的共性，手少阳三焦经也不例外。

手少阳三焦经向内联系三焦，络心包，同时也向外联系四肢末端的筋骨和肌肉，能够治疗心包和三焦的疾病，比如它能够治疗腹部胀满、小便不通，同时它也有退热的功效，比如手少阳三焦经上的外关穴就是一个退热的要穴。

此外，手少阳三焦经联系了很多脏腑，比如联系了耳，手少阳三焦经上很多腧穴都对耳朵起到了很好的治疗作用，治疗耳聋、耳鸣，比如中渚、液门，包括耳周的穴位。同时手少阳三焦经也可以治疗经脉循行线上的疼痛、活动不利等病症。