尖锐湿疣治疗总体原则是去除疣体和尽量清除病毒，如果病毒清除，尖锐湿疣可算彻底治愈。要想达到两个目标。临床的具体治疗方案可通过物理手段、化学手段，甚至中医中药的手段去除疣体，另外还可使用生物物品，应使用生物提高免疫力的药物以提高免疫力防止复发。还有中医中药外洗，也从复发的角度进行治疗。对于具体的物理手段上，微波、激光、冷冻等手段都可使用，甚至电灼都可达到去除疣体的目的。

从化学手段上用尤脱欣、鬼臼毒素或三氯醋酸也能够达到去除疣体的目的。而中医中药，比如鸦胆子之类的腐蚀性药物也能够达到去除疣体的目的。但要彻底清除病毒，应该用提高免疫力的手段，比如口服药物增加免疫力、局部外抹干扰素咪喹莫特、去清除病毒在周围的污染等，对防止以后复发有意义，所以尖锐湿疣的治疗因医生的个人经验不同而有所不同。尖锐湿疣治疗3-6个月的时间可以治愈，但应注意化学的腐蚀性药物，比如三氯醋酸、鬼臼毒素、尤脱欣类药物，如果患者想要使用药物去掉疣体，一定要注意保护正常的皮肤黏膜。

女性生殖结构比较复杂，最好不要乱用腐蚀性药物，因为腐蚀性药物多是液状，如果腐蚀性的液体流到正常的皮肤黏膜上，会将正常的皮肤黏膜腐蚀，就会引起病毒的人为种植。