试管婴儿做双胞胎成功的几率比自然怀孕要高几倍。人类是单胎动物，所以多胞胎包括双胞胎是妊娠期合并症，不利于胎儿发育，对于母亲而言，双胎妊娠的风险也会加大，包括妊娠期糖尿病、妊娠期高血压、先兆流产、早期早产的风险，都比单胎的风险要大。如果能够怀单胎，建议不要怀双胞胎，试管婴儿不以怀双胞胎为目的。
部分病人移植两个胚胎，评估后发现是双胞胎，而且病人的体型、年龄相对比较安全，此时可以在孕期加强产前检查。如果是高龄孕妇，而且患有基础病，比如原发性高血压或者糖尿病，则会加重疾病的风险。普通人怀双胞胎可能比较好，但是会给产科带来较大的风险，所以现在国际上流行的趋势是怀单胎，做单胎移植，而且双胎在发育时也难以足月，新生儿早产也有一定的风险。
