流脑疫苗可以引起腹泻，这是流脑疫苗一个比较少见的不良反应，常发生在注射流脑疫苗后24-48小时内，最常见是在24小时内出现，且持续时间较短，通常不会超过24小时，腹泻的症状也比较轻，不容易引起脱水。如果注射完疫苗后出现腹泻，极个别患者有可能出现比较明显的腹泻，出现脱水的症状，建议这种情况应该到医院就诊处理。
流脑疫苗还可以引起其他的不良反应，如注射部位的红、肿、热、痛，会出现低热，也会出现过敏反应、皮疹等。这些不良反应出现的几率较少，而且症状也比较轻，持续时间通常较短，均发生在注射疫苗后24-48小时内，通常不需要到医院处理，可自行缓解。极个别患者出现比较明显的不良反应，如体温在38℃以上，持续时间较长，这种情况下，需要到医院就诊，包括腹泻在内，如果出现了脱水的症状，也应该到医院就诊。
