脂蛋白a水平偏低，一般是比较好的情况，脂蛋白a水平增高，和动脉硬化的发生、进展，甚至斑块的破裂有关。在血脂代谢的过程中，有很多类物质参与，如甘油三酯和胆固醇，其不易溶于水，在血液中移动和转换时，以脂蛋白作为载体，和脂蛋白结合之后，就可以溶于水，可以在血液里，甚至进行跨细胞膜的转运。
高密度脂蛋白可以把血管壁上的血脂带回到肝脏，进行清除，可以防治动脉硬化。脂蛋白a类似于低密度脂蛋白，会把胆固醇从肝脏里带到外周的血管，如果带到了血管，沉积到血管壁上，可能会形成动脉粥样硬化的斑块，如果斑块越来越大，就会导致管腔狭窄。如果斑块破裂，有血栓生成，就会出现急性的缺血事件。
