在怀孕40天时是否能做人流手术需根据情况来分析，通常这个40天是指从末次月经的第1天开始算起。
如果女性平常的月经周期大约是28-30天，在停经40天时也就是停经还不到6周的时间段。如果经过超声检查已经能够明确发现宫腔内的妊娠、明确除外异位妊娠，而且宫腔内存在的妊娠囊已经直径大于1公分，则可以考虑进行人流手术。
但如果经过超声检查发现孕囊过小，还不到1公分，这时无法明确诊断为宫内孕。因为有时一些异位妊娠也有可能会出现宫腔内的假孕囊，因此如果经过超声检查无法明确诊断为宫内孕，也无法明确除外异位妊娠时通常会建议女性继续观察，等待1周后再继续复查超声。
通常1周后再次进行超声检查都是能够明确有没有宫内孕以及异位妊娠，只有已经能够明确为宫内孕、排除异位妊娠后才能考虑进行下一步的相应检查，如血常规。
盆腔炎、阴道炎、宫颈炎等这类炎症存在或者凝血功能障碍都有可能会导致人流手术出现比较严重的并发症，所以这些疾病在某种程度上都属于人流手术的禁忌证。如果出现这些状态，同样也不能做人流手术。
