甲基丙二酸血症患者能活多久，取决于甲基丙二酸血症的严重程度及基因突变的类型，不同疾病类型寿命可能不一样。此遗传代谢病的基因突变类型以及疾病突变类型，决定疾病严重程度。
比如发病是比较早的婴儿型疾病，由mut0突变引起，症状比较严重，发病比较早，对维生素B12治疗没有反应，此类孩子可能会影响寿命。
但是对于大多数的甲基丙二酸血症患者，对药物治疗尤其是对于维生素B12治疗有反应，使症状都能够缓解，通过饮食控制加上辅助治疗手段，比如肉碱的服用、甜菜碱的应用、维生素B12的应用等，可以几乎与正常人一样。
很多甲基丙二酸血症的孩子，从外观上分辨不出来与正常孩子唯一的区别，就是终身要用药物维持正常的甲基丙二酸水平，防止出现酸中毒等严重并发症。
