HLA-B27阴性，不能排除强直性脊柱炎。因为HLA-B27，是强直性脊柱炎非常相关的一个免疫抗原，在人群筛查当中，可能HLA-B27阳性的人发生强直性脊柱炎的几率，要比HLA-B27阴性的人群发生的几率高非常多。
但是在真正得强直性脊柱炎的人群中，HLA-B27的阳性率非常高，但是也有10%-20%的人群，HLA-B27为阴性。所以，存在着很多HLA-B27阴性的强直性脊柱炎的患者。
单纯的HLA-B27阴性，不能完全排除强直性脊柱炎。对强直性脊柱炎的诊断，需要结合着HLA-B27的检测情况，同时结合着患者的临床症状，还有骶髂关节、脊柱的影像学表现，还有一些免疫性指标，来综合判断。而不是通过HLA-B27，这一个指标来做出判断。
