结肠镜黏膜下剥离术主要针对结肠的广基息肉，或结肠黏膜下病变，比如无蒂腺瘤、高级别的上皮内瘤变以及结肠的早癌，即黏膜内癌或黏膜下不超过上1/3的早癌，可以通过结肠镜下进行剥离。即在做肠镜时，先在病变的周围注射生理盐水，让病变隆起，用肠镜下电刀沿着肿物边缘，在黏膜下进行完整的剥除，送到病理科去做化验。
结肠镜黏膜下剥离术较为微创，避免了以前由于病变较大可能需要开腹，或者要用腹腔镜切一段肠管，避免了比较大的手术。结肠镜黏膜下剥离术要求的技术比较高，对早期病变，如果能进行结肠镜黏膜下剥离术，应该是首选的较为微创的手术方式。
