不同原因引起的转氨酶升高，以及不同程度的转氨酶升高，疾病严重程度千差万别，恢复时间也不一样。转氨酶轻度升高，如服用感冒药或消炎药后转氨酶为60-80U/L，通过充分休息、停药以及适当的保肝治疗，通常1-2周可恢复正常。大量饮酒转氨酶达到几十U/L，通过戒酒和服用保肝药，通常1-2周内也能恢复正常。
严重的肝损伤，包括乙型肝炎、丙型肝炎和药物性肝炎引起的重度肝脏受损，如肝脏功能衰竭，转氨酶可以达到上百甚至上千U/L。同时伴有胆红素升高，即黄疸，患者可出现眼黄、尿黄，甚至肝昏迷、肝肾综合征等严重的并发症。这种严重肝脏疾患引起的转氨酶升高，无法短时间恢复正常，需住院治疗。针对不同的病因对因治疗，并且进行充分的保肝、护肝治疗，甚至需要人工肝治疗，肝脏功能才有可能恢复。部分患者若肝脏功能不能恢复，甚至需要进行肝移植。
