主要根据慢性咽炎具体原因，针对病因采取一定的治疗方法，尽量去除病因，慢性咽炎才会逐渐好转。正常咽部也有些淋巴滤泡，有慢性咽炎只是淋巴滤泡会增多，实际上慢性咽炎的不适症状不见得就是这些淋巴滤泡导致，或者多数时候不是这些淋巴滤泡导致，而这些淋巴滤泡只是咽喉的一个正常表现。
慢性咽炎一个常见的因素，是和胃酸胃液反流刺激导致的反流性咽喉炎有关系。因为反流性咽喉炎，多数患者可以没有反酸的感觉，所以导致这个因素经常被忽视，也就得不到及时有效的治疗。
所以导致了反流性咽喉炎的症状，包括咽部的异物感、烧灼感、堵塞感、咽痒、咳嗽等不适症状容易持续不愈，从而形成慢性咽炎。所以遇到这种情况一定要注意排除胃酸胃液反流的因素，必要时要用抑制胃酸的药物治疗，才能取得好的疗效。通常反流性咽喉炎需要连续用药6个月，才能达到持续稳定的效果。
