分为女性、男性或男女双方都同时的三大类。女性方面的引起不孕的原因，主要是排卵障碍。排卵障碍即下丘脑、垂体、卵巢、子宫轴生理功能失常，常见的原因是有多囊卵巢综合征、高泌乳素血症或卵巢功能低下、卵巢功能早衰。还有一些先天性的特纳氏综合征，卵巢功能低下等原因会影响到排卵障碍。管道的问题即输卵管方面的问题，往往是由输卵管的粘连、输卵管的积水、盆腔的炎症引起。子宫内膜异位症也会影响到输卵管同时影响到不孕。子宫的因素也即土壤的问题，常见的问题包括子宫内膜息肉、子宫黏膜下肌瘤、子宫腺肌症，还有子宫的先天性的畸形、单角子宫、幼稚子宫等。值得注意的是子宫纵隔一般不是绝对的影响不孕。免疫方面的因素例如抗精子抗体、抗子宫内膜抗体，也会导致的不孕。男性的不孕主要为精子的生成的问题，即少精子、弱精子。还有精子管道的问题，例如精索静脉曲张。
