卵巢巧克力囊肿会影响怀孕。卵巢巧克力囊肿学名也叫卵巢子宫内膜异位囊肿，其成因是在子宫内膜，应该是长在子宫腔里面。如果异位到卵巢，随着来月经就会出血，出血以后周围形成纤维素包裹。
然后里面有些成分会被吸收，剩下陈旧性的血形成如巧克力色的，一种稠厚的、包裹的内容物，因此叫做巧克力囊肿。其本身因为周围包裹、粘连，可以因机械性导致输卵管扭曲，也形成输卵管不通而导致不孕。
此外，还有可能因为本身内环境的问题，会干扰怀孕。即使在输卵管通的情况下，怀孕的几率也要比正常人低。另外，这种人如果为其进行促排卵治疗，或者是住院治疗，相对来说其成功几率也相对偏低。
因此，整体这个病会影响受孕。如果有比较大的巧克力囊肿，建议先做手术切除，不仅是切除囊肿，可能也需要改善盆腔的状况，这时受孕的几率会高很多。
