四价人乳头瘤病毒疫苗是预防HPV16、HPV18感染，以及HPV6和HPV11这2种低危型病毒感染。HPV病毒分上百种，其中导致宫颈癌最主要的病毒类型为HPV16、HPV18。女性70%的宫颈癌都是由于以上2种病毒造成，其他12种仅仅造成30%的感染。
所以这个疫苗设计出来就是为了减少70%的宫颈癌发生，即预防HPV16和HPV18这2种病毒的感染。除此之外四价疫苗还涉及了2种低危型的HPV预防，一个是HPV6，一个是HPV11，这2种病毒的感染。
这2种病毒不会造成宫颈癌，但会造成生殖道软疣，包括尖锐湿疣，如男性生殖道、肛门等部位的尖锐湿疣。因此，四价疫苗除预防宫颈癌之外，还能预防生殖道尖锐湿疣。
